JDK 1.1.8 과 1.3.1 모두 같이 사용할 수 있습니다.
/etc/environment 파일에 보면 PATH라는 환경변수가 있습니다.

예를 들어
PATH=/usr/jdk_base:/usr/jdk131
이라고 설정하면 기본적으로 Java 1.8.1을 사용하게 되고
PATH=/usr/jdk131:/usr/jdk_base
이라고 설정하면 Java 1.3.1 을 사용하게 됩니다.

enviornment를 바꾼 다음에는 한번 로그아웃했다가 다시 로그인하기 바랍니다.
or
. /etc/environment 하시어 적용하셔도 됩니다.